细菌基因组完成图真菌基因组完成图微生物群落多样性宏基因组测序服务全长转录组测序第三代测序服务非靶向代谢组学靶向代谢组学脂质组学离子组学脂肪酸检测氨基酸检测代谢组学服务定量蛋白质组服务双向电泳服务修饰蛋白质组蛋白质芯片蛋白质谱鉴定蛋白互作检测传统Western Blot全自动Western Blot蛋白质组学服务高通量测序数据分析蛋白质组学数据分析代谢组学数据分析芯片数据分析GO/Pathway富集分析相关性和聚类分析共表达网络图靶基因预测调控网络图蛋白相互作用网络图生物信息学服务CRISPR/Cas9载体构建稳定细胞系构建服务模式生物制备服务CRISPR/Cas9技术服务甲基化测序服务甲基化芯片服务甲基化验证服务DNA甲基化服务lncRNA测序服务lncRNA芯片服务lncRNA定量PCR验证lncRNA过表达服务lncRNA抑制服务lncRNA技术服务miRNA测序服务miRNA芯片服务miRNA定量PCR验证miRNA过表达服务miRNA抑制服务miRNA靶基因验证服务miRNA技术服务环状RNA测序服务环状RNA芯片服务环状RNA定量PCR验证环状RNA过表达服务环状RNA抑制服务环状RNA技术服务转录组测序服务表达谱测序服务mRNA/lncRNA/环状RNA 三合一芯片表达谱芯片服务荧光定量PCR验证mRNA过表达服务mRNA抑制服务数字PCR服务mRNA技术服务转录因子筛选服务抗体制备服务ChiP-Seq测序服务ChiP-qPCR技术服务EMSA技术服务luciferase 实验服务转录因子技术服务mRNA定量PCR检测miRNA定量PCR检测lncRNA定量PCR检测环状RNA定量PCR检测DNA拷贝数检测相对定量PCR服务绝对定量PCR服务荧光定量PCR服务整体课题服务SNP分型检测服务SSR/STR技术服务病毒包装服务CRISPR/Cas9技术试剂miRNA功能研究试剂lncRNA功能研究试剂环状RNA功能研究试剂mRNA功能研究试剂发表文献样品准备服务流程基金申请

表达谱芯片服务

服务详情

简介

表达谱芯片技术成熟,数据分析简单可靠,出结果时间短,芯片结果与荧光定量PCR验证吻合度高,价格便宜,性价比高,大批量样品进行表达谱检测时可以选择芯片技术。

芯片结果

包括聚类分析、SAM统计分析、SOM分析、Pathway显著性分析、GO功能显著性分析、基因调控网络图等。


芯片结果展示

1、芯片扫描图

  

 

2、差异基因聚类图

聚类图

样品要求

1、总RNA:浓度≥200 ng/μl,总量≥10 μg;

2组织样品:动物、植物、微生物总量大于300 mg的新鲜样品。

3、血液2ml以上,血清1ml以上。

4、保存在超低温冰箱中,利用干冰运输。

芯片种类

一、人类全基因组表达谱芯片服务

1、Affymetrix GeneChip Human Transcriptome Array 2.0 ——最新款同时检测4万多个编码基因和4万多个非编码基因

最高分辨率的基因芯片,支持所有转录本异构体的全转录组分析,包含超过六百万条不同探针,覆盖编码和非编码转录本。

该芯片为每个外显子设计约10条探针,每个外显子之间的剪接点有4条探针,确保每个实验都能获得完整、准确和可重复的数据。重复性高(批内相关系数≥0.99),所有检测过的组织观察到的变异系数(CV)<6.5%。样品类型既包括新鲜冻存样品,也包括FFPE 样本。

2、Affymetrix GeneChip Human Genome U133 Plus 2.0 Array——最经典芯片,已发表最多顶级文献                

此款芯片包含了47,000个转录本,代表了38,500个明晰的人类基因。数据库来源于GeneBank、dbEST、RefSeq、 UniGene database(Build 159 January 25 2003)、 Washington University EST trace repository、 NCBI human genome assembly(Build 31)。

3、Affymetrix GeneChip PrimeViewTM Human Gene Expression Array——最新款经济型芯片

新版人3’ IVT表达谱卡式芯片,利用GeneChip® Scanner

3000 7G system平台,据2011年6月份的数据库设计,覆盖人类基因组中确认的注解明晰的20000多个基因的36000多个转录本,具有超强灵敏度和高度的可重复性,低CV值,完全覆盖带注解基因组。

4、Affymetrix GeneChip Human Gene 2.0ST Array——新款芯片

Affymetrix新一代全转录本芯片,在一张芯片上可以同时检测mRNA和lincRNA,在其上一代1.0 ST Array的基础上,该芯片内容进一步丰富并更新数据库。2.0 ST Array有更多的优点:全面覆盖转录组,可以同时检测>30,000个编码的转录本和>11,000个长链非编码转录本;探针设计最大程度覆盖所有外显子,可检测选择性拼接/转录本变体。每个转录本覆盖特异探针的数目中值达到21种,每种探针的长度为25bp,这意味着每个转录本将被检测的碱基数中值高达525个;重复性高;灵敏度高。

5、Agilent SurePrint G3 Human Gene Expression 8x60K ——最新款芯片,同时检测编码基因和非编码基因

安捷伦人类表达谱芯片,基于G3平台。除了涵盖27,958条Entrez Gene RNAs外,更涵盖7,419条lincRNA。不仅能检测蛋白编码RNA表达量的变化,也能检测非编码RNA的表达量变化。探针设计参照的数据库为:RefSeq Build 36.3;Ensemble Release 52;Unigene Build 216;GenBank (April 2009)。非编码RNA探针是和John Rinn 实验室(隶属于麻省理工学院-哈佛大学博德研究所)共同设计的。

6、Agilent Whole Human Genome Oligo Microarray 4×44K ——经典芯片,已发表很多顶级文献

Agilent 的人全基因组表达谱芯片汇总目前所了解的人类全基因组序列信息,代表了超过41,000人类基因和转录本。设计该产品所用的序列信息源于对 RefSeq、Goldenpath、Ensembl和Unigene 等知名数据库的深入研究,并与人类基因组拼接进行比对。绝大多数探针经过 Agilent专利的实验验证程序的检验和优化。

二、小鼠全基因组表达谱芯片服务

1、Affymetrix GeneChipMouse Transcriptome Assay 1.0——最新款,同时检测2万多个编码基因和5万多个非编码基因

最高分辨率的小鼠基因芯片,支持所有转录本异构体的全转录组分析,覆盖超过23,000个编码基因(其中包括超过114,000个转录本; 332,000个外显子以及215,000个外显子簇)和超过55,000个非编码基因(其中包括101,000个转录本; 222,000个外显子以及162,000个外显子簇)。该芯片为每个外显子设计约10条探针,每个外显子之间的剪接点有4条探针,确保每个实验都能获得完整、准确和可重复的数据。重复性高,批内相关系数≥0.99。样品类型既包括新鲜冻存样品,也包括FFPE 样本。这种芯片的应用将加快人类疾病的临床前研究,提高了从小鼠模型研究转化到人类疾病研究的成功率。

2、Affymetrix GeneChip Mouse Genome 430 2.0 Array——最经典芯片,发表最多顶级文献

Affymetrix 小鼠基因组430 2.0芯片涵盖了39,000个转录本,代表34,000个明晰的小鼠基因。序列信息基于GeneBank、dbEST、RefSeq、UniGene database。

3、Affymetrix GeneChip Mouse Gene 2.0 ST Array——新款芯片

小鼠全转录本芯片,在一张芯片上可以同时检测mRNA和lincRNA,可同时检测>35,000个编码的和非编码的转录本及>2,000个长链基因间非编码转录本

4、Agilent SurePrint G3 Mouse Gene Expression 8x60K ——新款芯片,同时检测编码基因和非编码基因

安捷伦最新设计的小鼠表达谱芯片,基于G3平台。除了涵盖39,430条Entrez Gene RNAs外,更涵盖16,251条lincRNA。不仅能检测蛋白编码RNA表达量的变化,也能检测非编码RNA的表达量变化。探针设计参照的数据库为:RefSeq Build 37;Ensembl Release 55;Unigene Build 176;GenBank (April 2009);RIKEN 3。

5、Agilent Whole Mouse Genome Oligo Microarray, 4×44K——经典芯片,已发表很多顶级文献

Agilent 小鼠全基因组表达谱芯片真正代表小鼠基因组中所有已知基因及其产生的转录本,代表了超过 41,174 个小鼠基因和转录本。设计该产品所用的序列信息源于对 UCSC、NIA、RefSeq、Ensembl、Unigene和RIKEN等知名数据库的深入研究,而且绝大多数探针经过Agilent专利的实验验证程序的检验和优化。

三、大鼠全基因组表达谱芯片服务

1、Affymetrix GeneChip® Rat Transcriptome Assay 1.0 (RTA 1.0)——最新款,可同时检测25000个编码基因和61000个非编码基因

芯片介绍:RTA1.0芯片中,每个外显子约有10条探针,每个外显子-外显子剪接位点有4条探针。该分析可产生最全面、准确和可再现的全转录组表达数据。

2、Affymetrix GeneChip Rat Genome 230 2.0 Array——最经典,已发表最多顶级文献

Affymetrix 大鼠基因组230 2.0芯片包含有31,000个probe sets,代表28,000个明晰的大鼠基因。序列信息基于GenBank , dbEST, RefSeq等权威数据库。

3、Affymetrix GeneChip Rat Gene 2.0 ST Array——新款芯片

大鼠全转录本芯片,在一张芯片上可以同时检测mRNA和lincRNA,可同时检测>27,000个蛋白编码转录本及>23,500个 Entrez基因

4、Agilent SurePrint G3 Rat Gene Expression 8x60K Kit——新款芯片

安捷伦最新设计的大鼠表达谱芯片,基于G3平台。涵盖30,003条Entrez Gene RNAs。探针设计参照的数据库为:RefSeq Build 36.2;Ensembl Release 55;Unigene Build 177;GenBank (January 2009)。

5、Agilent Whole Rat Genome Oligo Microarray, 4×44K——经典芯片

Agilent 大鼠全基因组表达谱芯片真正代表大鼠基因组中所有已知基因及其产生的转录本,代表了超过 41,012 个大鼠基因和转录本。设计该产品所用的序列信息源于对 RefSeq、Ensembl、Unigene 和GenBank等知名数据库的深入研究,而且绝大多数探针经过Agilent专利的实验验证程序的检验和优化。

四、其他物种表达谱芯片服务

Affymetrix 3' IVT Expression Array: 拟南芥、苜蓿、稻、大豆、大麦、小麦、柑橘、棉花、玉米、白杨、甘蔗、西红柿、葡萄、酵母、果蝇、秀丽隐杆线虫、牛、犬、鸡、猪、恒河猴、非洲爪蟾、热带爪蟾、斑马鱼。

Affymetrix Gene 1.0 ST Array : 拟南芥、苜蓿、稻、大豆、果蝇、秀丽隐杆线虫、牛、犬、鸡、猪、恒河猕猴、食蟹猕猴、马、猫、豚鼠、狨猴、羊、兔、恒河猴、斑胸草雀、斑马鱼、番茄。

Agilent 3' IVT Expression Array:拟南芥、苜蓿、稻、大麦、棉花、芸苔属植物、烟草、西红柿、小麦、酵母、大肠杆菌、稻瘟菌、果蝇、秀丽隐杆线虫、蚊子、牛、犬、鸡、猪、马、恒河猴、兔、三文鱼、羊、非洲爪蟾、斑马鱼。