细菌基因组完成图真菌基因组完成图微生物群落多样性宏基因组测序服务全长转录组测序第三代测序服务非靶向代谢组学靶向代谢组学脂质组学离子组学脂肪酸检测氨基酸检测代谢组学服务定量蛋白质组服务双向电泳服务修饰蛋白质组蛋白质芯片蛋白质谱鉴定蛋白互作检测Western Blot蛋白质组学服务高通量测序数据分析蛋白质组学数据分析代谢组学数据分析芯片数据分析GO/Pathway富集分析相关性和聚类分析共表达网络图靶基因预测调控网络图蛋白相互作用网络图生物信息学服务CRISPR/Cas9载体构建稳定细胞系构建服务模式生物制备服务CRISPR/Cas9技术服务甲基化测序服务甲基化芯片服务甲基化验证服务DNA甲基化服务lncRNA测序服务lncRNA芯片服务lncRNA定量PCR验证lncRNA过表达服务lncRNA抑制服务lncRNA技术服务miRNA测序服务miRNA芯片服务miRNA定量PCR验证miRNA过表达服务miRNA抑制服务miRNA靶基因验证服务miRNA技术服务环状RNA测序服务环状RNA芯片服务环状RNA定量PCR验证环状RNA过表达服务环状RNA抑制服务环状RNA技术服务转录组测序服务表达谱测序服务mRNA/lncRNA/环状RNA 三合一芯片表达谱芯片服务荧光定量PCR验证mRNA过表达服务mRNA抑制服务mRNA技术服务转录因子筛选服务抗体制备服务ChiP-Seq测序服务ChiP-qPCR技术服务EMSA技术服务luciferase 实验服务转录因子技术服务mRNA定量PCR检测miRNA定量PCR检测lncRNA定量PCR检测环状RNA定量PCR检测DNA拷贝数检测相对定量PCR服务绝对定量PCR服务荧光定量PCR服务整体课题服务SNP分型检测服务SSR/STR技术服务病毒包装服务CRISPR/Cas9技术试剂miRNA功能研究试剂lncRNA功能研究试剂环状RNA功能研究试剂mRNA功能研究试剂发表文献样品准备服务流程基金申请
宏基因组测序服务
服务详情

简介

  微生物种类繁多,培养条件复杂。据统计现今只有1%的微生物可以在实验室进行纯种培养。宏基因组学是将环境样品中的微生物群落作为整体进行研究的学科。与其他研究环境群落的方法相比,宏基因组测序具有通量大、产出数据多、更为高效的优势。采用宏基因组测序的方法对微生物群落进行研究,不仅能够获得样本微生物物种的组成和丰度信息,还可以进行功能基因注释,获取样品间基因差异信息。

  宏基因测序是指对环境样品中所有微生物基因组DNA片段化后进行高通量测序,进行序列组装和基因注释,获得部分不可纯培养微生物的基因组序列,分析该环境下所有微生物基因集信息。  

  通过宏基因组测序,能够解释微生物群落多样性、种群结构、进化关系、功能活性及环境之间的相互协作关系,极大地扩展了微生物学研究范畴。

生物信息分析

1. 原始数据整理、过滤及质量评估

2. 基于物种丰度分析:    物种丰度列表    稀释曲线

3. 基于物种丰度分析:    丰度分布曲线图    生物多样性指数(α多样性)列表    物种丰度差异性分析列表    多样品物种分布柱图    丰度差异物种聚类分析    PCA图    Krona图

4. 基因丰度列表:    提取基因分级注释丰度列表(KO、NOG、subsystem)    功能基因列表    生成venn图    基因丰度差异性分析列表    丰度差异基因聚类分析    富集分析(KO)

5. 根据客户需求进行个性化分析

结果展示

1、样品稀释曲线


2、不同样品微生物群落结构差异


3、实验组和对照组丰度差异基因的GO功能分析


4、实验组和对照组丰度差异基因的Pathway分析


5 全基因组拼接环状图

样品要求

1、样品采集:样品采集条件的一致是最为重要的环节,严格按照采样标准采样,采样后立即封存样品冷冻保存。

2、样品DNA:环境因素异常复杂,许多物质或抑制因子影响后续PCR、测序文库构建和序列测定,常规提取方法不一定适合,建议采用专用试剂盒提取。PE文库DNA浓度≥20 ng/μl,总量≥6 μg(荧光定量),并确保电泳检测无明显RNA条带,基因组条带清晰、完整;基因组DNA完全无降解;提供DNA电泳检测照片,用自封袋密封后随样品一起送样;组织样品﹥1.5 g。

3、样品保存期间切忌反复冻融。

4、送样管务必标清样品编号,管口使用Parafilm膜密封。