长链非编码RNA（lncRNA）是一类长度超过200 nt的RNA分子，不编码蛋白，位于细胞核或胞质内。lncRNA在基因表达调控、物种进化、胚胎发育、物质代谢以及肿瘤发生等过程中均具有重要作用。

根据lncRNA在基因组上相对于蛋白编码基因的位置，可以分为5种类型：正义链（sense）、反义链（antisense）、双向（bidirectional）、内含子间（intronic）、基因间（intergenic），其所在的位置与其功能有一定的相关性。

lncRNA的特点有：

1、与编码基因相比，lncRNA表达量更低；

2、lncRNA通常较长，有启动子结构，可发生不同剪切，部分有polyA尾巴；

3、lncRNA启动子同样可以结合转录因子；

4、大多数的lncRNA在组织分化发育过程中，都具有明显的时空表达特异性；

5、序列上保守性较低，但功能上具有一定的保守性。

lncRNA的作用机制（见下图）：

1、编码蛋白的基因上游启动子区（橙色）转录，干扰下游基因（蓝色）的表达；

2、抑制RNA聚合酶II或者介导染色质重构以及组蛋白修饰，影响下游基因（蓝色）的表达；

3、与编码蛋白基因的转录本形成互补双链（紫色），干扰mRNA的剪切，形成不同的剪切形式；

4、与编码蛋白基因的转录本形成互补双链（紫色），在Dicer酶的作用下产生内源性siRNA；^]

5、与特定蛋白质结合，lncRNA转录本（绿色）可调节相应蛋白的活性；

6、作为结构组分与蛋白质形成核酸蛋白质复合体；

7、结合到特定蛋白质上，改变该蛋白质的细胞定位；

8、作为小分子RNA（如miRNA、piRNA）的前体分子。