蛋白质组学（Proteome）概念由澳大利亚科学家Wilkins和Williams在1994年意大利科学会议上首次提出，指基因组表达的所有相应的蛋白质，即细胞、组织或机体全部蛋白质的存在及其活动形式。蛋白质组与基因组相对应，也是一个整体的概念。基因组是静态的，一个生物体的基因组在其一生中基本上是稳定不变的，但基因组内各个基因表达的条件和程序则是随时间、地点和环境条件而变的，因而其表达产物的种类和数量随时间、地点和环境条件而变化。所以说蛋白质组是一个动态的概念，它是在组织、细胞的整体蛋白质水平上，探索蛋白质作用模式、功能机理、调节控制以及蛋白质群体内的相互关系，从而获得对疾病过程、细胞生理病理过程及调控网络的全面而深入的认识，以揭示生命活动的基本规律。同时也为临床诊断、药物筛选、新药开发和个性和医疗等诸多应用领域提供理论依据。

　　修饰蛋白质学包括单个或全部蛋白质的磷酸化、乙酰化、泛素化、甲基化、N-糖基化、O-糖基化等已知修饰类型，还有巴豆酰化、琥珀酰化、丙酰化、丁酰化、丙二酰化和戊二酰化等新型修饰。目前越来越多的研究发现，许多重要的生命活动、疾病发生不仅与蛋白质的丰度相关，更重要的是被各类蛋白质翻译后修饰所调控。