简介
靶向代谢组学分析主要是以标准品为参照,对特定的代谢物群进行有针对性地、特异性地检测与分析。靶向代谢组学分析成功的关键因素是准确度、高通量和可靠性。虽然这类分析比靶向代谢谱分析更为常规,但必须面对非常大批量的样品。
靶向代谢组学可以应用于:
1、验证由非靶向代谢组学实验发现的差异代谢物;
2、针对客户参考文献提供的一组给定的代谢物,比如某一条或者几条代谢通路的代谢物,进行定性定量的研究,并研究其生物学意义。
实验流程
靶向代谢组学和非靶向代谢组学区别
| 非靶向代谢组 | 靶向代谢组 |
目的 | 发现差异代谢物,寻找biomarker | 注重目标代谢产物,一般以通路为主 |
定性定量 | 可以定性,相对定量 | 定性定量同时进行,可以检测浓度 |
方法 | 直接进样即可分析,成本相对较低 | 需先购买标准品,进行方法学验证再检测,成本较高 |
技术优势
1、拥有标准化的实验室操作规范和先进的仪器平台,实验周期短,质量可靠。
2、拥有Waters Quattro Premier XE三重四极杆液质联用仪(MRM)、Agilent 7890A-5975C气质联用仪(SIM)等多种靶向仪器平台。
3、拥有专业的生物信息团队和大型硬件,可以为客户提供个性化的生物信息分析服务。
结果展示
1、特定代谢物在各样品中的浓度的聚类分析图
2、各样品主成分分析(PCA)
3、特定代谢物在实验组和对照组中的浓度差异
4、差异代谢物biomarker的ROC曲线分析
样品要求
1、植物样本最少200mg,血液样品至少1ml(血浆注意用肝素钠防凝),血清0.5ml,尿液2ml,动物组织样品至少1g,细胞样品为1×107个细胞,酵母、微生物等干重200mg。
2、样品保存与运输:在液氮或-80°C保存。干冰运输。
参考文献
1.Liu, R., et al., Determination of polyamine metabolome in plasma and urine by ultrahigh performance liquid chromatography-tandem mass spectrometry method: application to identify potential markers for human hepatic cancer. Anal Chim Acta, 2013. 791: p. 36-45.
2. Roberts LD, Souza AL, et al. Targeted metabolomics. Curr Protoc Mol Biol. 2012; Chapter 30:Unit 30.2.1-24.