简介
蛋白质谱鉴定,是对完整的组织、体液或其蛋白提取物,SDS-PAGE条带或2D蛋白斑点酶解成肽段混合物,通过液相色谱分离,串联质谱,质谱仪会选取某些肽段进行再次破碎(即二级质谱),得到更小的氨基酸序列片段,进行检测最后用相应的数据库进行检索匹配,鉴定蛋白质名称。
服务内容
1、蛋白质全谱鉴定(shotgun)
蛋白质全谱鉴定也可称为质谱shotgun分析,研究对象是完整的组织、体液或其提取物,其目的在于鉴定出尽可能多的肽和蛋白质分子。将溶液内蛋白质分子或SDS-PAGE条带的复杂混合物酶解成肽段混合物,通过液相色谱分离,串联质谱,质谱仪会选取某些肽段进行再次破碎(即二级质谱),得到更小的氨基酸序列片段,进行检测最后用相应的数据库进行检索匹配,可同时鉴定成百上千种蛋白质。客户只需提供>10μg蛋白溶液或足量样品,我们提供整套实验及鉴定的蛋白列表、蛋白相互作用图、GO功能和Pathway分析等结果报告。
2、蛋白质胶条/混合液鉴定
对于胶条样本(即SDS-PAGE样本、IP、co-IP、Pull-down等纯化溶液等中等复杂样本,利用LC-MS/MS质谱技术进行蛋白鉴定。客户只需提供清晰可见的考染、银染(质谱兼容)条带或>10μg蛋白溶液或足量样品,我们提供整套实验及结果报告。
3、蛋白质胶点鉴定
利用MALDI-TOF/TOF质谱技术对考/银染的2D或DIGE胶点样本或者较纯的蛋白样本进行蛋白鉴定。
结果展示
1、蛋白鉴定一级质谱图
2、蛋白鉴定二级质谱图
3、蛋白鉴定表
4、蛋白相互作用图
5、数据库检索结果
参考文献
Li GY, Chen J, Xie P*, Jiang Y, Wu LY, Zhang XZ. Protein expression profiling in the zebrafish (Danio rerio) embryos exposed to the microcystin-LR. Proteomics (2011) 11: 2003–2018.