言行生物可以对定量蛋白质组学数据、修饰蛋白质组学数据、双向电泳结果等数据进行各种系统化和个性化的生物信息学分析。
结果展示
1、GO功能分析
在蛋白组学中，对大规模的鉴定结果经常用pie图或bar图表示蛋白的某个分类，如亚细胞定位、生物功能、生物通路等。
说明：Bar图表示鉴定蛋白在分子功能上的富集度。
通过一般数据库查询给出特定蛋白的GO信息烦多，很难进行统计分类。我们可以将所有鉴定蛋白的GO都slim到特定的GO分类上，便于下一步的统计和图示化。
说明：Pie图表示鉴定蛋白在亚细胞定位上的分类。
2、Pathway通路分析
对已鉴定蛋白可以mapping到通路数据库中，给出mapping的统计结果并图示化。
说明：蛋白标记定量数据在KEGG通路图中的mapping
3、网络分析
通过蛋白的差异谱或实际鉴定谱，可以在各种相互作用数据库中找到对应的相互作用蛋白，并构画出相互作用网络。
说明：鉴定蛋白构建相互作用网络。
说明：鉴定蛋白构建Transfac转录调控网络。
4、聚类分析
说明：用聚类热图展示蛋白相对定量数据中表达趋势相近的蛋白
5、修饰蛋白质组学研究
蛋白特定的修饰鉴定后，想挖掘修饰位点附近氨基酸组成的状况，可以用聚类图或氨基酸比例图展现。
说明：用热图形式展示靶标修饰氨基酸附近的氨基酸组成情况
说明：用概率图形式展示靶标修饰氨基酸附近的氨基酸组成情况
6、IPA 分析 (商业软件，需要license)
IPA是一种公认的生物数据分析工具，非常适用于疾病相关的数据分析。它的主要特色在于根据实际数据找到疾病分子的网络和通路，甚至在其基础之上构建自己的网络和通路。
说明：IPA捕捉到差异分子形成网络。
7、GSEA 分析
可以结合表达量的数据找到相关的基因集合。此处，基因集合泛指包含一堆基因的类别名称，可以是GO中的某一类，通路中的某一条或转录调控和相互作用网络中的某个小模块。
说明：GSEA捕捉到差异分子的基因集合
