Gene Ontology（简称GO）是基因功能国际标准分类体系。GO可分为分子功能（Molecular Function），生物过程（biological process）和细胞组成（cellular component）三个部分。GO-Analysis对差异基因等按GO分类，并对分类结果进行基于离散分布的显著性分析、误判率分析、富集度分析，得出与实验目的有显著联系的、低误判率的、靶向性的基因功能分类，该分类即导致样本性状差异的最重要的功能差别。通过该分析有可能找到导致性状变化的重要功能，并且找到该功能所对应的基因。

　　通常可以对转录组测序或表达谱芯片发现的差异基因，或者蛋白质学发现的差异蛋白，或者lncRNA/miRNA/环状RNA的预测靶基因进行GO功能分析。

结果展示

1、富集分析列表（可发现基因集中属于某些功能亚类）

2、GO富集分析图

3、GO分析饼图

Pathway分析

　　信号通路（Pathway）是多个蛋白质间相互作用，共同调节细胞功能和代谢活动的过程。而信号通路分析是通过对差异基因按照Pathway的主要公共数据库KEGG和Biocarta来进行分类，对Pathway中的基因进行基于离散分布的显著性分析，得到与实验目的有显著联系的Pathway 分类,该分类即导致样本性状差异的最重要Pathway。

　　通常可以对转录组测序或表达谱芯片发现的差异基因，或者蛋白质学发现的差异蛋白，或者lncRNA/miRNA/环状RNA的靶基因进行pathway分析。

结果展示

1、Pathway富集分析列表（可发现基因集中属于某些代谢通路）

2、Pathway富集分析图

3、Pathway详图(红色基因上调、绿色基因下调)