简介
Illumina在原450K芯片巨大成功的基础上,推出了新一代的850K甲基化芯片,可检测人全基因组约853,307个CpG位点的甲基化状态,其中包含了原450K芯片91%的位点,并增加了413,745个位点。850K芯片不但保持了对CpG岛,基因启动子区的全面覆盖,还特别加强了增强子区(新增了333,265个探针覆盖来自ENCODE及FANTOM5计划的增强子)以及基因编码区的探针覆盖。广泛应用于干细胞研究、肿瘤和其他复杂疾病研究,是目前最适合表观基因组全关联分析研究的全基因组DNA甲基化芯片。
芯片结果
统计甲基化区域(peak)多样本 peak差异分析及聚类分析
统计peak相关的基因及注释
peak相关基因的GO和 pathway显著性富集分析
结果展示
1、聚类分析图
2、GO功能分析
3、Pathway分析
样品要求
1、样品类型:细胞、新鲜组织或DNA样品。
2、样品量:细胞样品请提供至少2×107个细胞,组织样品请提供至少100mg的组织块或切片,DNA样品请提供10 μg以上的DNA。