简介
近年的研究表明基因的转录调控受到多种模式的影响,其中microRNA调控是重要的调控模式。现已发现,基因的转录后调控并不是简单的microRNA-mRNA的沉默机制,而是一个复杂的调控网络:很多非编码RNA分子富含microRNA结合位点,在细胞中起到miRNA海绵(miRNA sponge)的作用,进而解除miRNA对其靶基因的抑制作用,升高靶基因的表达水平,这一作用机制被称为竞争性内源RNA(ceRNA)机制。而在ceRNA机制中,circRNA和lncRNA是最典型的miRNA海绵吸附体。因此,深入了解基于circRNA和lncRNA的ceRNA调控机制,有助于我们更好的理解个体发育或疾病发生发展过程中的精细调控机制,也有利于提示我们circRNA或者lncRNA在药物开发和疾病诊治中的应用前景。
芯片特点
1、芯片同时覆盖环状RNA、lncRNA、mRNA。一份芯片数据同时提供三个层面的表达信息,circRNA和lncRNA作为典型的内源竞争性RNA,此款芯片可以让您畅游ceRNA调控研究。
2、可同时检测8万多个个circRNA、7万多个lncRNA、约2万个mRNA;
3、circRNA所有探针设计基于最新最全的国际主流circRNA数据库信息。
结果展示
1、lncRNA靶基因预测
基于位置和序列预测:lncRNA 调控机制分为顺式 (cis-)调控和反式(trans-)调控。寻找基因组位置在10kb 之内的 lncRNA-mRNA对(cis-),以及lncRNA和mRNA(3' UTR)序列相似的lncRNA-mRNA对(trans-)。

2、lncRNA和mRNA共表达网络图(左边为所有lncRNA,右边为单个lncRNA)
